西班牙腹泻哺乳仔猪中A组轮状病毒和其他肠

题目：西班牙腹泻哺乳仔猪中A组轮状病毒和其他肠道病原体研究

总结：新生仔猪腹泻是全球养猪业经济损失的一个主要原因。多种感染因子可导致这种情况发生，其中A组轮状病毒(RVA)等病毒起主要作用。研究它们的发生和遗传多样性对于RVA疫苗的开发至关重要。在这项研究中，使用分子方法对来自西班牙各地猪场的腹泻哺乳仔猪粪便样本进行了RVA和其他四种常见肠道病原体的分析。产气荚膜梭状芽胞杆菌、艰难梭状芽胞杆菌、A组轮状病毒、C组轮状病毒和猪流行性腹泻病毒（PEDV）的个体发病率分别为89.4%、64.4%、44.9%、33.7%和4.4%。大多数样本(96.9%)至少有一种病原体阳性，80%以上混合感染。研究表明RVA具有广泛的遗传多样性，与西班牙现有疫苗所含的基因型存在差异，这些发现有助于监测西班牙猪群中传播的RVA，并可能有助于优化目标疫苗设计。

摘要：轮状病毒(RVA)是一种引起哺乳仔猪腹泻的主要病毒病原体。在本研究中，对28日龄以下腹泻仔猪的粪便样本(n=)进行了为期两年(-年)的分析。样本来自西班牙36个省的个猪场，并使用qPCR和RT-qPCR对5种肠道病原体进行了检测。产气荚膜梭状芽胞杆菌、艰难梭状芽胞杆菌、A组轮状病毒、C组轮状病毒和猪流行性腹泻病毒（PEDV）的个体发病率分别为89.4%、64.4%、44.9%、33.7%和4.4%。大多数样本(96.9%)至少有一种病原体阳性，80%以上混合感染。对70份RVA阳性样本进行核苷酸序列测定，发现VP7血清型为G4、G9、G3、G5、G11和VP4血清型为P7、P23、P6和P13，其中G4P7和G9P23组合最为常见，在猪群数量最多的地区尤为明显。研究表明RVA具有广泛的遗传多样性，与西班牙现有疫苗所含的基因型存在差异，不同G-和P-血清型的抗原表位与疫苗株存在多种氨基酸差异。需要进一步的研究来确定疫苗对异源病毒株的临床保护作用。

图1：西班牙地图。在本研究中用于诊断肠道病原体样本的猪场位于图中灰色标注省份。

表1：28日龄以下仔猪粪便样本中肠道病原体[阳性数量(%)]

表2：70份A组轮状病毒阳性样本中G血清型和P血清型的组合，随机选取西班牙不同猪场腹泻仔猪样本(1个样本/猪场)。

表3：在本研究中RVA不同血清型的核苷酸序列比对，鉴别出最大单核苷酸多态性(SNPs)数量。

图2：RVAG血清型系统发育树。当前研究中代表毒株(标有*)和疫苗株RVA/Pigtc/USA/LS_Gottfried//G4P6(KR)、RVA/Pig-tc/USA/LS_OSU//G5P9(KR)和RVA/Pig-tc/USA/A2/x/G9P9(AB)。

图3：RVAP血清型系统发育树。当前研究中代表毒株(标有*)和疫苗株RVA/Pigtc/USA/LS_Gottfried//G4P6(KR)、RVA/Pig-tc/USA/LS_OSU//G5P9(KR)和RVA/Pig-tc/USA/A2/x/G9P9(AB)。

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